FZC se rige por la Ley de Fundaciones, su posterior desarrollo reglamentario y por sus Estatutos. Asimismo, se acoge a Ley de régimen fiscal de las entidades sin fines lucrativos y de los incentivos al mecenazgo.
Actualmente el Patronato está formado por once miembros tanto de naturaleza colegiada como individual, fruto de la pluralidad, la colaboración y la convergencia entre la iniciativa pública y la privada. El cargo de Presidente de la Fundación lo ostenta actualmente D. Jorge Azcón Navarro, Alcalde del Excmo. Ayuntamiento de Zaragoza, siendo la Vicepresidenta, Dña. María Teresa Santos Martínez (Fundación Bancaria Ibercaja) y el Director, D. Daniel Sarasa Funes.
Exmo. Ayuntamiento de Zaragoza
Fundación Bancaria Ibercaja
Fundación Universidad de San Jorge
Siemens S.A.
Universidad de Zaragoza
Dña. Alejandra Cortés Pascual
D. Marcos Latorre Díez
Dña. Carmen Berné Manero
D. Guillermo Pascual López
Asociación TECNARA
Asociación IDiA
Dña. Carmen Herrarte Cajal – Consejera de Economía, Innovación y Empleo
D. Javier Rodrigo Lorente – Concejal del Grupo Municipal Ciudadanos
D. Alfonso Mendoza Trell – Concejal del Grupo Municipal Popular
D. Luis Miguel García Vinuesa – Concejal del Grupo Municipal Socialista
Dña. Luisa Broto – Concejala del Grupo Municipal Zaragoza En Común
D. Julio Calvo – Concejal del Grupo Municipal VOX
D. Fernando Rivarés – – Concejal del Grupo Municipal Podemos- Equo
Dña. Beatriz Giner – Representante de la Fundación Universidad de San Jorge
D. Fernando Hazeu – Representante de SIEMENS, S.A.
D. Ángel Pueyo – Representante de la Universidad de Zaragoza
D. Manuel Pérez Alconchel – Representante de TECNARA
D. Antonio Novo – Representante del Clúster IDiA